Le vignoble fut créé au milieu du XVII° siècle par la famille de Fontemoing, négociant à Libourne et propriétaire de plusieurs domaines, dont le Château Canon. La famille Giraud leur succéda et à la fin du XVII° siècle le vin était connu sous le nom de « Pomerol-Giraud Cru de Trotanoy ». Le nom de Trotanoy provient d'une caractéristique de son terroir exceptionnel. Le sol se compose en effet d'un mélange de terres argilo-graveleuses et argileuses. Il fut ainsi affublé du qualificatif « trop ennuy », car, en période de forte chaleur, la forte proportion d'argile rend le sol dur comme de la pierre, et par conséquent difficile à travailler. Au XIX° siècle le domaine couvre 25 hectares, mais ventes, partages et successions diminueront de moitié sa surface à la fin des années 1920. Après la guerre, Trotanoy est vendu à la famille Pecresse, puis, en 1953, à Jean-Pierre Moueix. Les vignes du domaines, d'un âge moyen de 25 ans, avaient échappé aux gelées de 1956, mais nombre d'entre elles avaient été fragilisées, et un vaste programme de replantation est mis en uvre dans les années 1970. Ce qui explique une relative légèreté des vins produits dans les années 1980. Vinifiés selon les mêmes méthodes que Petrus, les vins dont élevés de 12 à 18 mois dans des barriques dont le pourcentage de bois neuf varie selon les années de 50% à 66%. Non filtrés avant leur mise en bouteille, les vins, d'une richesse et d'une intensité remarquables, développent des arômes de cerise et de framboise. D'un grande régularité, même dans les petits millésimes des années 1970, par exemple, Trotanoy est aujourd'hui revenu au meilleur niveau : depuis 1995, il talonne Petrus à la dégustation.
